Budući je shizoafektivni poremećaj relativno nova dijagnostička kategorija, (navodi se tek nešto više od 10 godina ), relativno je malo epidemioloških podataka koji govore o incidenciji ili prevalenciji bolesnika s tim poremećajem.
Smatra se da se shizoafektivni poremećaj javlja rjeđe od shizofrenije, a češće od afektivnog poremećaja. Isto tako se sa sigurnošću tvrdi, da je u obitelji osoba sa shizoafektivnim poremećajem veći udio i shizofrenih i osoba s afektivnim poremećajem nego u općoj populaciji.
